中文Nuovo ceppo della variante del coronavirus 501Y-V2 del Sud Africa
Il 18 dicembre 2020, il Sudafrica ha rilevato un mutante 501Y-V2 del nuovo coronavirus.Ora il mutante sudafricano si è diffuso in più di 20 paesi.Gli esperimenti hanno dimostrato che sopra i mutanti del Nuovo Corona-virus possono essere portatori di altre varianti del Nuovo Coronavirus delle mutazioni K417N/T, E484K e N501Y che possono ridurre la capacità neutralizzante degli anticorpi neutralizzanti plasmatici indotti dal vaccino.Tuttavia, rispetto al genoma di riferimento Wuh01 (numero di sequenza MN908947), la sequenza genomica mutante 501Y.V2 del Sud Africa ha 23 varianti nucleotidiche.Ha la stessa mutazione N501Y del sottotipo B.1.1.7 del mutante britannico, ma contiene ancora mutazioni in due siti chiave E484K e K417N della proteina S che hanno effetti potenzialmente importanti sulla capacità del virus di infettare.
Il nuovo coronavirus è un virus a RNA a filamento singolo, le cui mutazioni genomiche sono più frequenti.Il rilevamento di un singolo target può facilmente portare al mancato rilevamento di campioni con carica virale bassa e ceppi virali mutati.Il tasso di riesame nel singolo positivo nel rilevamento del target può raggiungere oltre il 10%, il che può aumentare il carico di lavoro e prolungare il tempo di diagnosi.Il rilevamento multi-bersaglio e la verifica reciproca dei risultati di ciascun bersaglio possono aumentare il tasso di rilevamento e facilitare la diagnosi precoce.
Figura 1. Diagramma schematico del meccanismo di infezione del Nuovo Coronavirus
Nuovo coronavirus mutante B.1.1.7 della Gran Bretagna
Il 26 dicembre 2020 è stato pubblicato online il primo articolo scientifico del ceppo B.1.1.7.L'Institute of Hygiene University of London UK and Tropical Diseases, ha confermato che il ceppo B.1.1.7 è più capace di diffondersi rispetto ad altri ceppi, percentuale superiore al 56% (IC 95% 50-74%).Poiché questo nuovo ceppo mutante ha un potere di trasmissione più evidente, è diventato più difficile controllare il COVID-19.Il giorno successivo, l’Università di Birmingham nel Regno Unito ha caricato un articolo su MedRxiv.Lo studio ha rilevato che il numero di copie dei geni dei virus ORF1ab e N nei pazienti infettati dal ceppo mutante B.1.1.7 (dropout del gene S) era significativamente aumentato;questo fenomeno è stato monitorato nella popolazione.Questo articolo sottolinea che i pazienti infettati dal mutante B.1.1.7 della Gran Bretagna hanno una carica virale significativamente più elevata, quindi questo mutante potrebbe anche essere più patogeno.
Figura 2. La sequenza della mutazione del genoma contenuta nel ceppo mutante del coronavirus B.1.1.7 della Gran Bretagna
Figura 3. La mutazione N501Y è avvenuta sia in Gran Bretagna che in Sud AfricaVarianti
Kit di rilevamento di nuove varianti di coronavirus
Chuangkun Biotech Inc. ha sviluppato con successo un kit di rilevamento per le nuove varianti di coronavirus B.1.1.7 e 501Y-V2.
Vantaggi di questo prodotto: elevata sensibilità, rilevamento simultaneo di 4 bersagli, che coprono i principali siti di mutazione del ceppo mutante B.1.1.7 e del ceppo mutante sudafricano 501Y.V2.Questo kit è in grado di rilevare contemporaneamente i siti di mutazione N501Y, HV69-70del, E484K e il nuovo gene del coronavirus S;Test veloce: è necessaria solo 1 ora e 30 minuti dalla raccolta del campione al risultato.
Figura 4. Rilevamento della curva di amplificazione della variante britannica del COVID-19
Figura 5. Rilevamento della curva di amplificazione della variante sudafricana del COVID-19
Figura 6. Curva di amplificazione del nuovo coronavirus wild-type
Non è chiaro come queste mutazioni accumulino il nuovo impatto a lungo termine della pandemia di COVID-19.Ma questo ci ricorda che queste mutazioni possono influenzare l’efficacia dell’immunità naturale e dell’immunità determinata dalla vaccinazione.Ci ricorda inoltre che dobbiamo monitorare continuamente il nuovo coronavirus per un lungo periodo e aggiornare il vaccino contro il COVID-19 per far fronte all’evoluzione del nuovo coronavirus.
Orario di pubblicazione: 12 marzo 2021